至20日，广州、佛山、东莞、顺德、江门、清远等地商团陆续被缴械、遣散，以‘扣械事件‘引发的‘商团事变‘最后终于以武力平定收场。在镇压商团过程中，不法军人、地痞和土匪乘机在广州商业最繁华的地区：西关一带大肆烧杀抢掠，其结果是悲剧性的。
整个事情的经过，周华也向钟泱递交了一份经过整理的报告，详细的叙述了事情的起因经过和结果。
十月九日，新任代理广州市长李福林取得商团同意，经孙核准，发还扣械，商团纳款二十万，又允许政府抽一次特别捐，其数目相当于广州全市一个月的房屋租金。孙于是日下午电令姜瑞元将扣械移交李福林。
但同时又另密电姜率全部学生军离开黄埔，运扣械到韶关，参加北伐。次日，孙再电姜，作同样的要求。姜覆电不同意放弃广州，主张死守黄埔，并劝请孙回广州平乱。
十日下午，商团派队收械，当装运至剩下四箱时，忽有工团军一千五百至二千人，企图冲过商团防线，为商团击败，事后双方均以挑衅相责。按工团军为廖仲恺所组织，以与商团对抗。而廖仲恺这老实过头的傻蛋，明显是被红门的马子任等亲俄分子给利用了。
商团收械后，发觉不但不足原数，枪械仅有四千支，而原数为九千支；子弹二十余万发，原数二百余万发，而且全是旧械，不是哈佛号运来的新械。
因此十分气愤，发动罢市如故。
十一日，孙仿效苏俄办法，组织“**委员会”，自任会长，特派许崇智，廖仲恺，汪兆铭，姜瑞元，谭平山等六人为委员，以弭平商团事变。十二日，吴铁城之警卫军全部回省。十三日，五千军队由东江前线亦调返广州。
十四日，孙命胡汉民为代理**委员会会长，廖仲恺为秘书，姜瑞元为军事委员长，与苏俄政府代表鲍罗廷共同筹划镇压商团事宜。根据日后在美国发表的鲍氏本人所作的报告，是日会议中，即决定以全力围攻西关，一鼓扑灭商团。
各小队伍如工团军，甲车队等统归姜瑞元指挥。又以汪精卫为政治部长，吉少山，廖仲恺，谭平山等三人副之，以筹划**委员会及各军队的行动。
商团方面，陈廉伯等领导者误以滇军的范石生、廖行超等人与福军的李福林对自己的行动表示同情，又恃各县乡民团为后盾，及外国领事团的同情，天真的以为孙不致采三激手段，故集中西关，戒严自卫，拒绝复市。
可到了十四日下午，许军，福军与警卫军开始在回澜桥，西门，太平门一带向商团进击，两方相持均四五小时后，吴铁城遂开炮轰击西关。
十五日晨，商团退守西关内围，以街闸为护，与政府军互相射击。十一时左右，政府军唆使理发工人，以三百箱煤油，放火焚城。西关房屋，密切相连，材料又多用木材，一时火势蔓延，无法控制。下午二时左右，商团遂停止其抵抗。到了晚上，大部份西关已在火焰之中。
根据地宫提交的报告，**政府军占据屋顶，向逃出街上的人，不分商团难民，乱行射击。一大群难民，逃往太平马路，被政府军迫退回火区，卒至焚毙。
大火到十七日晨，才自行烧尽。先抢劫，后焚烧的地点，统计大兄道三十余条，商户约二千余家，损失五千万以上；抢劫地点，统计大兄道六十余条，商户一千余家，损失不可估计。其惨酷情形，和清兵入关亦不遑多让。
计十五日之一天，大焚劫后，商民之希望孙政府停止焚杀，殆与满清兵入粤时，自第一甫杀至第十九甫止，市民叩头谢恩，请勿再杀，同一情形。而暴兵于十六日仍大焚大掠如故，广三码头之放火焚毁，万目共睹，皆知为福军放火。
十六日下午，长堤一带又抢劫如故。至十七日，本为**政府征服商民之第三日，而**政府仍未宣布解严。福军把守太平路禁止行人，张民达所部大焚大掠后，又在惠爱西路捕杀人多名，被杀者有穿便服，如普通商人者，不问何故，捉到就杀，商民生命危险如此。
西关屠城之后，孙在粤很难站着了。五天后的十月二十三日，北京发生政变，冯玉祥倒戈，促成吴佩孚之下台，与段祺瑞回京组阁。二十四日，冯即电请孙中山北上“共商国是”。
北冯南孙，皆苏俄政府企图操纵中国的安排。当年孙，冯行动一致，绝不是偶然的事,。孙中山遂于十一月十三日启程取道日本北上，这次离开，却是再也没回广东。。.。
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