在我还没有找到答案以前，我要更加努力，我要努力钻研佛经，我要努力修练自己，我绝对不要拿生命开玩笑，我一定会找出解救众生痛苦的方法，找到生命的奥秘。
在净土寺第三年，也是玄奘十五岁时，发生一件大事。捷同与玄奘接到家书，知道父母已死，两人伤心欲绝。原来天下叛军四起，在家乡的父母，已经被盗匪杀死。听到这消息，捷同与玄奘立刻赶回家乡。
一路上看见许多难民，大家纷纷逃难。隋末炀帝引起全国大乱，东北有高鸡泊窦建德、华北唐李世民父子、华中瓦岗寨李密、东南杜伏威……等等叛军起义，天下乱世一发不可收拾。两人赶回到家乡，家乡已经被战火洗劫，死的死、亡的亡，好不容易寻得父母的尸首，恰巧已经出嫁的姊姊张氏也赶回，姊弟三人抱头痛哭。
玄奘想起父母自小就对他疼爱有加，想不到分别两年，却是阴阳相隔，他内心万分痛苦。战火持续燃烧，叛军就快要杀到，他们实在没有时间好好安葬父母，临时用几块木板拼凑，挖个坑将父母葬入。玄奘跪在父母坟前，痛哭失声。
玄奘不天﹐夙种荼蓼┘娓词狈晁迓药o殡掩仓卒……讣文写得哀凄动人，手抓着泥土，一手一手将父母埋进土中，其姊张氏也是伤心欲绝。
捷同表情平淡，并不如同玄奘那样伤心，他劝玄奘说道︰出家人应该六根清净，我们已经是化外之人，岂能将世俗的感情放在心头？
我无法放下，死的是我们的父母，我岂能放下心？
玄奘你太过于感情用事，总有一天，你会被情字所困。
玄奘、捷同虽然是亲兄弟，但他们对佛理的理解却有所不同，捷同太过强调修行，克制妄想，渐渐地将人类的感情抛弃，以致日后兄弟的理念日行渐远，最后在佛理领悟过程中两人起了冲突。玄奘是性情中人，他无法割舍人与人之间的感情，对父母的恩情，他谨记在心。
这次事件也造成玄奘的日后冲击，看见父母的惨死，更加深他对死亡的恐惧。当天晚上，他做一个梦，他看见一座坟碑，碑上写着︰玄奘法师葬于此地，于甲子年殁六十三岁。
玄奘从恶梦中惊醒，对梦中境界记得一清二楚︰这个梦……，难道是上天告诉我？我只能活到六十三岁？我现在十五岁，那意思就是说，我只有四十八个年头可以活了？
知道死期，是一件多么可怕的事，玄奘心中充满恐惧。他日子一天一天的过，等待死期的到来，面如槁木，心中万分痛苦。
上天为什么要告诉我这个讯息？难道要我每天过着提心吊胆的日子？要我等待死亡的到来？不，这种日子我绝对过不下去，我要摆脱痛苦，摆脱对死亡的恐惧，我一定寻得解救万生痛苦的方法，寻得生命的奥秘。
玄奘更加钻研佛经修练自己，但是天下大乱未平。十七岁时，河南一带暴徒聚集，寺院里众僧流离失所，纷纷逃亡；路上都是死尸白骨，人民在饥饿之中挣扎，于是玄奘跟捷同说道。
天下混乱至此，我们又何必坐以待毙？我听说李渊已经率领晋阳人攻进长安，长安大至抵定，不如我们去长安？
捷同赞成玄奘的建议，兄弟两人前往长安，此时李渊已经在长安称帝，是为武德元年。
草创期的唐朝，群雄间战火未熄，打战为首要之务，无暇他顾。此时长安并无佛教道场，玄奘看到这种情形，深深感慨。隋炀帝曾在东都洛阳建造四所道场，招聘天下名僧驻寺，高僧云集各有擅长，其中以慧景、敬脱、道基、宝暹最为杰出。隋末大乱，各寺院生活来源断绝，很多僧侣远走绵、蜀，在偏僻的蜀地反而有许多精通佛法的高僧。
于是玄奘又向捷同建议︰如今长安佛法荡然无存，我们不能在这里虚度光阴，应该到蜀地去研习佛法。
捷同接受，两人经由子午谷进入汉川，拜见空、景两位法师。兄弟二人在此停留一个多月，跟随两位法师学习经典，之后随同前往成都。
蜀地聚集许多高僧，大开佛教讲座法筵，兄弟二人在此苦心研究佛经，玄奘也在此时正式受戒成为比丘。玄奘、捷同本身学问就很好，领悟力也强，经听由道基、宝暹二法师讲解《摄论》与《毗昙》，以及道震法师讲解《迦延》，经过二、三年的苦心研究，两人精通各种佛理。
当时天下大乱，全国都在闹饥荒，唯独蜀地太平无事，而且物资丰实不虞匮乏，所以天下僧侣都聚集蜀地。每巢座往往有几百人听讲，盛况空前。
玄奘、捷同年轻博学因而声名大作，两人高风亮节、品行端正，名气响遍吴、蜀、荆、楚，当时每个人都想目睹两人风采，他们在佛门的声誉遥遥直上，那时玄奘只有二十岁。