如今在清江下游和清江与长江交汇处的石板巷子、茶店子和鸡脑河等遗址的发掘中，发现了相当于中原龙山文化末期至夏代早期的巴文化遗存，但由于发掘工作做得较少，所获资料有限,还难于作出更为确切的论证。至夏禹时期，巴国加入夏王朝，成为夏王朝的诸侯之一。
《左传·哀公七年》载：禹“会诸侯于会稽，执玉帛者万国，巴蜀往焉。”至此，巴国成为夏的统治集团的一个部分。《山海经·海内南经》记载：“夏后启之臣曰孟涂，是司神于巴，巴人请讼于孟涂之所，其衣有血者乃执之。是请生。（孟涂）居山上，在丹山（泸州丹山景区位于泸州市南114公里的叙永县境内，由分散的几个景点组成，总面积200多平方公里,为国家级旅游景点）西。
丹山在丹阳（属太湖流域，位于江苏省南部，地处长江三角洲、上海经济圈腹地，属苏南经济板块，东邻常州市武进区、新北区，西接句容市、镇江市丹徒区，南与金坛市接壤，北接镇江新区，并与扬中市隔江相望，是一座具有悠久历史的文化古城。
1987年经国务院批准撤县建市，被列为沿海对外开放城市，是江苏省经济发展水平较高的县（市）之一。）南，丹阳居属也。”《竹书纪年》也记载：“帝启八年，帝使孟涂人巴涖讼。”
商代这一阶段共分两层:遗址第⑥层文化层据碳十四测定年代数据为距今3520±130年，相当于中原商代早期文化层;第⑤层文化层相当于商代中、晚期夏末商初，巴作为夏的一部分，参与了夏与殷的斗争，起码在夏灭亡的时候，巴并没有成为商的同盟。《山海经·大荒西经》记载：“有人无首，操戈盾立，名曰夏耕之尸。故成汤伐夏桀于章山，克之，斩耕厥前。耕既立，无首，厥咎，乃降于巫山。”巫山，即巴国所在，巴国收留了夏亡国后的遗民。在商代，巴没有完全臣服加入殷政权，反而和殷发生过战争。殷墟文字记载说明，公元前13世纪的殷武丁时期，武丁和妇好都曾经征讨过巴国。商代中、晚期遗址第⑤层出土的商代中、晚期文化遗物,以陶器为大宗,石器呈明显下降的趋势,陶器中以釜为器类之冠,占陶器总数的90以上,次为罐、钵、杯、豆、纺轮和网坠。釜的器形大小不一,有夹砂灰褐陶、褐陶、黄褐陶等,饰有细绳纹、方格纹、蓝纹等。说明这一时期,随着生产的发展,制陶技术的进步,以陶釜为特征的代表**物在早期巴文化中逐步占据其重要位置。此外,在该地层中还出土了数量较多的卜骨和与生活相关的兽骨,卜骨用大鱼的左鳃盖骨制成,均有钻孔。钻孔大多为椭圆形、圆形和长方形,一般凿槽较深,有的已凿穿,烧灼痕迹明显,有的可看见兆纹。
西周公元前11世纪，巴的军队作为前锋加入了周武王伐纣的战争。也因此在周灭商后，正式成为周王朝的诸侯国之一，并入周王朝的疆域。
《华阳国志·巴志》称：“巴师勇锐，歌舞以凌殷人，前徒倒戈，故世称之曰：‘武王代纣，前歌后舞’，也。武王既克殷，以其宗姬封于巴。”春秋时期的楚国逐渐强大，驱赶巴国的疆域不断向西迁移。《华阳国志·巴志》载：“巴、楚数相攻伐”“巴子怒，伐邓，败之。其后巴师、楚师伐申。楚子惊巴师。鲁庄公十八年，巴伐楚，克之。”“鲁文公十六年，巴与秦、楚共灭庸。”“哀公十八年，巴人伐楚，败于鄾。”《左传·桓公九年》：“文十六年（即公元前611年）以后，巴遂不见，盖楚灭之。”最终楚国夺取了巴国经济的根基：位于巫溪和清江的盐业基地。逼使巴都城也沿江向西迁移。《华阳国志·巴志》：“巴子时虽都江州（重庆主城区），或治垫江（重庆合川），或治平都（重庆丰都），后治四川阆中。其先王陵墓多在枳（重庆涪陵）”到战国时期，《华阳国志·巴志》说：“七国称王，巴亦称王。”其疆域是“东至鱼复（重庆奉节），西至僰道（四川宜宾），北接汉中，南极贵州北部。”巴国依然还是一个疆域广阔，可与七国相比的国家。
陶器其中陶釜的数量达2100多件,占陶器总数的88.3左右。陶质有夹砂褐陶、灰褐陶、黄褐陶、、泥质灰陶、灰褐陶等。纹饰有方格纹、绳纹、回形纹等。器形的制作以手制为主,不少器壁还保留有手指按窝,说明在西周时期,以陶釜为特征的代表**物在巴文化中依然十分兴盛。除陶釜之外,其它陶器器类有罐、盆、钵、杯、纺轮、网坠等。陶质印章还出土了两枚陶质印章,印章印文为阴刻。张政良认为:陶玺印文字属巴蜀文化系统。
陈公柔认为:两玺印出在早期巴文化遗址西周地层中,当然是巴人比较早的玺印。夏渌认为:两玺印印文一为“蔡”,一为“鲛”,前者与甲骨文相近,后者与有巨口有利齿的水生动物有关。是中国玺印历史中的文字记载找到了第一件实物例证,在此之前,我国