最后，公会战争所带来的结果是联邦奠立了它在这个星区中的地位，变成第一强权。
联邦的“探勘者”们无休止地往外扩张。随着联邦的执法者不断滥用权力，海盗和各地自组的民兵开始如雨後春笋般出现。这其中最著名的一个例子就是公然抗争联邦政策的克哈星（kohal）。
而就在这个时间段，一批异位面的入侵者进入了星际争霸位面，他们混入联邦中，混入了克哈星。
在他们的阴谋下，克哈星如同原剧情一样走向了叛乱。
不过，这一次克哈星的叛乱却掌握在了这些乱入者手中，他们以此来谋夺整个联邦，而他们的目的，只是联邦各星手中的高科技……