刘秀曾经告诫吴汉：“成都有十多万部队，不可轻视。只要坚守广都，待他们来攻时，不要与他们争锋。如果他们不敢来攻，你转营强迫他们接战，必须等到他们精疲力竭，才可以发起攻击。”吴汉求胜心切，率兵二万进逼成都，倚江为营。自驻江北，留副将刘尚率万余人屯守江南，相距二十余里，在江岸修筑浮桥作为联络。刘秀闻知大惊，遣使责问吴汉道：“我对你下过许多指令，为什么事到临头又乱套了呢？既轻敌深入，又与刘尚另建营垒，如事情急迫，就来不及了。敌军如果出兵牵制你，而以大兵攻刘尚，刘尚被攻破了，你也就败了。幸亏现在没事，你赶快引兵回广都。”诏书尚未赶到，公孙述便已派谢丰、袁吉率兵十余万围攻吴汉，另派万余人攻刘尚，使其两不能救。
吴汉与谢丰大战一日，兵败还营，召诸将训话：“今与刘尚二处受围，势既不接，其祸难量。欲潜师就尚于江南，并兵御之。若能同心一力，人自为战，大功必立；如其不然，败必无余。成败之机，在此一举。”诸将应诺。于是闭营三日不出，乘谢丰等不备，夜间拔营疾走与刘尚合军。谢丰、袁吉发觉后急忙率兵追击，吴汉等奋力迎战，大败蜀军，斩谢丰、袁吉。
吴汉回到广都后，留刘尚拒公孙述，上书报告刘秀，而且自我谴责。刘秀道：“你回广都，很是适宜，公孙述必不敢忽略刘尚而攻击你。如果他先攻刘尚，你从广都五十里率全部步骑赴敌，刚好遇到他的危困，必可破蜀兵。”此后，两军激战于广都、成都之间，汉军八战皆捷，围困成都。公孙述自率数万人出城大战，吴汉使护军高午、唐邯率精兵数万人冲锋陷阵。蜀兵大乱，高午冲入阵中刺伤公孙述，公孙述返回城中伤重而亡。次日，公孙述大将延岑开城出降。吴汉率部入城，放兵大掠，族灭公孙述、延岑家族，烧毁宫室，残杀百姓。刘秀大怒，严词谴责吴汉，又指责副将刘尚失伐罪吊民之义。
需要注意的事情是，吴汉在攻破成都之后，放兵大掠，族灭公孙述、延岑家族，烧毁宫室，残杀百姓。
可以说，吴汉这样做，也有一些明哲保身的可能性，因为萧何也曾经为了自保，而不惜自污。
毕竟在军事方面，吴汉在这之前立下的功劳仅次于刘秀以及邓禹，若是再加上攻灭公孙述的功勋，一旦刘秀听取一些关于吴汉的谗言，吴汉有可能会下场凄惨。
当然，岑彭被公孙述派遣刺客刺杀而死，也许也是吴汉做出这种事情的原因所在。
但是不管如何，对比关于公孙述的相关记载，吴汉的做法算得上是相当不厚道。
……
更始三年（公元25年），更始帝刘玄失败以后，光武帝刘秀正忙于山东事务，没有来得及西伐。关中豪杰吕鲔等往往拥有兵众达万，不知归属，多往归公孙述，公孙述都拜他们为将军。于是大作营垒，陈车骑，肆习战射，会聚兵甲数十万人，在汉中积聚粮食，在南郑修筑宫殿。又造十层赤楼帛兰船。多刻天下牧守的印章，备置公卿百官。使将军李育、程乌率领数万军众出陈仓，与吕鲔侵犯三辅。建武三年（公元27年），征西大将军冯异攻击吕鲔、李育于陈仓，大败吕鲔与李育，吕鲔与李育逃奔汉中。建武五年（公元29年），延岑、田戎被汉兵打败，延岑、田戎军等都逃亡入蜀。
延岑，字叔牙，南阳人。开始起兵时据有汉中，又拥兵关西，关西破散，又走到南阳，占有数县。田戎，汝南人，初起兵于夷陵，转而侵掠郡县，发展到数万人。延岑、田戎都与秦丰会合，秦丰都以女儿嫁给延岑、田戎为妻。后来秦丰失败，延岑、田戎都向公孙述投降。公孙述以延岑为大司马，封汝宁王，封田戎为翼江王。
建武六年（公元30年），公孙述派遣田戎与将军任满出江关（今夔门南岸），下临沮、夷陵间，招其故众，因而想攻取荆州诸郡，但没能攻克。
当时，公孙述废除铜钱，置铁官以铸钱，百姓手中的货币不能流通。蜀中童谣说：“黄牛白腹，五铢当复。”好事的人们窃窃私语说王莽称“黄”，公孙述自号“白”，五铢钱，是汉货，说天下当并还刘氏。公孙述也喜好为符命鬼神瑞应的事，荒谬地引用谶书。以为孔子作《春秋》，为赤制而断十二公，说明汉高帝至汉平帝已经过十二代，历数已完，一姓不得再受命为帝。又引《录运法》说：“废昌帝，立公孙。”《括地象》说：“帝轩辕受命，公孙氏握。”《援神契》说：“西太守，乙卯金。”说西方太守而轧绝卯金刘氏。五德之运，黄承赤而白继黄，金据西方为白德，而代王氏，得到正序。又说自己手纹有奇，得以建元龙兴之瑞。几次将这些东西移书中原，希望以此惑动众心。
光武帝忧虑，就写信给公孙述说：“图谶上讲的‘公孙’，就是汉宣帝。代汉的是当涂高，你难道是当涂高吗？你以掌纹为瑞，王莽有什么可以效法的呢！你不是我的乱臣贼子，仓卒时人人都想当上皇帝，不足责备。你日月已逝，妻子儿女