慈禧太后知道恭亲王的心思后，两次和光绪帝多次前往探视恭亲王，恭亲王也利用这样的机会向太后和皇上表达了自己的忧虑。
恭亲王躺在病床中，见到慈禧和年轻的光绪皇帝，挣扎着要丫鬟扶他起来行礼。慈禧太后说免了，恭亲王挣扎坐起后，对光绪皇帝说：“皇上，老臣有一言，不得不说，现在尔父已仙逝，老臣也命不久矣，请皇上尊重太后，她毕竟政事娴熟。汝在用人行政上要格外小心，恪守成法，维系人心，与那些忠于大清国的大臣们，比如李鸿章、荣禄等共同商量，治理国家，经武整军，富国强兵。吾虽在府内，亦闻有广东举人主张变法，皇上当慎重，不可轻任小人。”
光绪皇帝这时有了自己的主见，回答恭亲王说：“当今天下，人心思变，朕不过是顺势而为罢了。”
恭亲王咳嗽了两声，道：“皇上，大清国确实应该进行某些方面的改革，但这种改革只能是旧有体制的完善，而不能另起炉灶从头开始。翁同龢、康有为等人的所谓‘从内政根本’进行改革的构想，以及在内廷设立制度局的想法，实际上是要另起炉灶，意在废我军机。果如此，以皇上的政治智慧和经验阅历，势必沦为翁同龢、康有为手中的傀儡，那样不仅对我满洲皇族不利，对大清王朝也极端危险啊。望皇上三思！”
光绪皇帝听恭亲王攻击康有为，还攻击他的老师翁同龢，有点不满，道：“朕受翁师傅多年的教导，他从未欺骗过朕，朕也不曾发现他弄权。”
“那是皇上阅人不深啊。”恭亲王又咳嗽了两声，用生命的最后一点力气对光绪皇帝说：“以臣多年与翁同龢共事的经验了解，翁同龢居心叵测，并及怙权，如果不对他进行防制，将来一旦他与康有为等人联手，必将祸及大清国。”
慈禧太后听了恭亲王的临终交代，点点头，道：“六哥，你放心吧，哀家虽老了，但也不会任凭皇上胡来的。”
年轻的光绪帝感到格外恼火，因为被恭亲王所不齿的翁同龢，是自己敬重多年的师傅。但是人之将死，其言应善，光绪皇帝决定试探一下翁同龢对自己的忠诚度。翁同龢也收买了慈禧太后身边的太监，他很快得到了也知晓恭亲王的临终遗言，吓出了一身冷汗，他知道恭亲王在慈禧心中的分量，心想要保住自己的地位与权势，就必须马上与康有为等维新人物一刀两断，至少要暂时割断关系。毕竟，他是协办大学士、军机大臣、总理大臣、户部尚书，而康有为本来只是一个举人，为了他把自己搭进去，太不值了！
那天晚上，光绪皇帝试探翁同龢，向翁同龢索要康有为的著作。此时，已有心理准备的翁同龢，出于自我保护的本能，矢口否认与康有为有来往，更没有他的著作：“臣身为军机大臣、总理大臣，怎么会有此人的著作？”
翁同龢的反常回答，使光绪帝不快，因为皇上清楚地记得正是这位师傅向他不止一次地推荐过康有为，甚至不止一次地希望皇上能够破格召见康有为。光绪皇帝问道：“康有为不是老师您推荐的吗？怎能说没有与康有为往来呢？是什么原因使你不与康有为往来？”
翁同龢说：“刚开始臣以为康有为不错，后来臣和荣禄、李鸿章一起去天津召康有为问话后，顿觉得此人狂妄无知，居心叵测。”
翁同龢这个回答，更使光绪皇帝反感，道：“翁师傅先前竭力推荐康有为，怎么现在他竟然变成了‘居心叵测’的小人，那么你先前是怎样考察的？你先前为什么不详说？”
翁同龢镇定自若，回答说：“先前没有看到过康有为的全部著作，最近得读他的《孔子改制考》，他乱改圣人之言，于是臣得到这样的认识。”
光绪皇帝心里有些愤怒，自从他见过恭亲王后，翁同龢就跟以前判若两人了？他决定今天不再与师傅理论，待明日师傅调整好情绪再说。第二天，光绪帝重演昨日故事，再次提起康有为，翁同龢并没有忘记恭亲王的遗言，依然如昨日一样回答了光绪皇帝的问题：“康有为居心叵测，可能是政治小人，臣现在与康有为也没有什么往来。”
翁同龢的回答，彻底激怒了光绪皇帝，因为这在很大程度上证明了恭亲王的判断是正确的，翁同龢要变法确实居心不良。光绪皇帝觉得翁同龢怂恿他维新变法，并不是为了富国强民，而是为了公报私仇，搞倒李鸿章。翁同龢自以为聪明矢口否认与康有为往来，殊不知弄巧成拙，反而暴露出自己政治上不诚实的一面，验证了恭亲王的评判。光绪皇帝心寒不已，觉得翁同龢已不可信。但是，迫于翁同龢身为帝师，位高权重，还是帝党的中流砥柱，不好公开翻脸，表面上还是对翁同龢毕恭毕敬。
光绪皇帝不搞翁同龢，不代表慈禧太后也不会动他。就在光绪维新变法的第四天，慈禧太后忍无可忍，发布懿旨，发动突然袭击，罢免翁同龢，光绪皇帝措手不及，完全没有心理准备。
懿旨送到时，正是翁同龢六十三岁的寿辰。光绪皇帝正在毓秀宫的大殿大张旗鼓给老师过生日，当时朝中