马刺开局惊艳，14场比赛中赢了11场，包括相继战胜达拉斯、菲尼克斯和休斯敦。蒂姆-邓肯也有幸在那段时间里成为了职业生涯总分超过15000分大家庭中的一员。马刺队史的新纪录12连胜直到102-111不敌金州勇士后才画上了句号。2006年12月2日战胜国王队后，马刺超越凯尔特人，以59.5的胜率荣登历史第二名。然而随着赛季的进行，马刺实现崇高理想的道路愈加坎坷。一月收获9胜7负担成绩后，二月初又不得不吞下1胜3负的惨淡战果。几场激战过后，马刺很快已经被达拉斯小牛和菲尼克斯太阳落下很远。事实上，马刺领先西南赛区第三名火箭也仅仅1.5个胜场。交易传闻渐渐笼罩灰心丧气的马刺。交易截止日已经非常临近，*维奇不得不在是否保持现有团队间作出决定。他决定不进行交易。这仿佛成了整个赛季的转折点，马刺暗下决心打好剩下的每一场比赛。二月和三月，马刺通过强硬的防守和在绝境中投进关键球一举豪取13连胜。在常规赛后期的31场比赛中25胜6负，场均得到98.9分，同时将对手限制在场均87.9分，重回西部强队之列。即便马刺依然赶不上西南区冠军小牛队，他们还是以良好的状态杀入季后赛。
马刺在主场赢来2007年季后赛的首场比赛，对手是丹佛掘金。马刺的慢热在常规赛早就显露出来，这样的状态一直延续到了季后赛。相对于掘金的顽强，马刺一开始还没找不到感觉。“黄金双枪”顺势砍下了61分，而邓肯只有14分10个篮板进账。掘金首战95-89力克马刺。
第二场，“石佛”邓肯终于恢复了自己应有的状态，22分7个篮板帮助马刺97-88取得胜利的同时扳平了大比分。从此之后，马刺就再也没有给掘金翻身的机会。除了邓肯和帕克的稳定发挥，老将芬利、霍里纷纷发飙，马刺干净利落地4比1淘汰掘金，迈入第二轮。当马刺将掘金拒之门外时，常规赛67胜15负的小牛却2-4爆冷败给了金州勇士队。小牛队意外出局时的马刺次轮对抗菲尼克斯太阳队的比赛成为了季后赛的焦点之战。场均30.2分12.5个篮板3.1记盖帽的邓肯再次在强强对话中占据了内线的优势。哪怕是不可一世的“小霸王”阿玛雷-斯塔德迈尔，在邓肯面前也显得无能为力。虽有助攻好手史蒂夫-纳什，但“三叉戟”和强硬的板凳让马刺在这次“准冠军”比赛中显得更具冠军气势。马刺最终4-2告捷，但第四场中对纳什恶意犯规的罗伯特-霍里遭到了禁赛2场的处罚。那些说“马刺对太阳系列赛就相当于总决赛”的没有说错。马刺随后4-1轻取犹他爵士，挺进2007nba总决赛。
马刺队在总决赛中以4比0横扫勒布朗-詹姆斯所率领的克利夫兰骑士队，再夺总冠军，成为nba历史上继凯尔特人、湖人、公牛队后，第四支夺得4次及以上总冠军的nba球队。
2007-082007-08赛季中联盟进行了几场大交易，包括凯文-加内特和雷-阿伦携手加盟波士顿凯尔特人队，沙奎尔-奥尼尔进驻菲尼克斯太阳队，以及保罗-加索尔入伙洛杉矶湖人队。马刺没有卷入任何大交易，只是赛季中期交易到了西雅图的“疯狂之眼”科特-托马斯。
尽管打出了17胜3负的强劲开局并且在二、三月份连胜11场，马刺依然屈居几支刚刚经过大交易的球队以及其他几支迅速崛起的球队之下。马刺以56-26的成绩以西部第三的身份挺进季后赛。马刺在季后赛第一轮再次面对去年饱受争议的半决赛对手菲尼克斯太阳队。马刺队4-1淘汰太阳晋级西部半决赛。次轮的对手是以克里斯-保罗为首的新奥尔良黄蜂队。马刺和黄蜂鏖战7场后险胜对手，与湖人会师西部决赛，但最终1-4遗憾结束卫冕之旅。