准格尔汗国和其他漠西蒙古各部，大明推行蒙人治蒙、藏人治藏的政策，划分片区。
各部首领三年一次进行会盟，由各部首领轮流担任盟主，受征西都护府的管理。
且盟主只有对蒙古各部的监督权，不能干预各部事务，也无权私自发布政令，各部内部仍然享有很大的自治权，和满清的盟旗制度类似。
治理西藏和新疆，朱慈烺都是采用了后世清朝的边疆政策，不得不说，鞑清对管理边疆却是有一套，值得赞扬。
在经济方面，大明增加通商口，与蒙、藏两族全面通商贸易，并且允许他们和大明其他省份进行自由通商来往。
这条政策，比什么都来的实用。
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