李茂贞的本钱差不多都打光了，无奈之下，只好腆着老脸向朱温请和，并把责任全栽到了韩全诲等人的头上。在请了李晔的旨意后，李茂贞诛杀宦官以韩全诲为首七十余人，献头汴营。
唐天复三年（公元903年）正月，李晔幸汴营，朱温素服伏地，长哭请罪。李晔知道朱三在演戏，也只好假惺惺的劝慰：“非卿相救，社稷已成灰土矣。”
数日后，朱温护送李晔回长安，及至长安时，朱温又开始做起了“忠臣”，牵李晔马前行，一直走出了十多里地，行人见之，多称朱温为忠臣。宰相崔胤以下迎于城外，舞蹈三呼。
朱温得手之后，就开始着手处理宦官问题，因为李晔幸岐就是太监们给折腾出来的，朱温决计斩草除根。同月，朱温和崔胤具名上奏：“天宝以来，阉人得势，握兵权，行大逆，累弑君王，作乱天下。请陛下惩前车，绝后患，罢诸司监军。”李晔早就恨透了太监，巴不得如此，当然准奏。
朱温发兵捕拿宦官数百人，除了留下数十老弱太监侍奉皇帝外，其余不论善恶，一体诛夷。宦官势力自李辅国时开始坐大，到了元和朝，开弑君先河，把持朝政，为害甚烈，久为天下所诟恶，自此，唐朝的宦官祸彻底被扑灭。
朱温安顿李晔后，回到了汴州，虽然没把李晔带在身边，但长安已为朱温控制，实际效果是一样的。皇帝虽然尊贵之极，但也要看是什么样的皇帝，手中有权那是真皇帝，否则，象汉献帝刘协、东魏孝静帝元善见、唐昭宗李晔这样的空头皇帝，连自己的生死都无法掌握，当的窝窝囊囊，还不如一个草头王自在。权力才是最尊贵的。至于名义上是不是，并不重要。
西患解除后，朱温开始扫除东边的一些讨人嫌的家伙，首先就是在朱温西征期间手脚极不干净的平卢军节度使王师范。唐天复三年（公元903年）四月。朱温派侄子朱友宁率兵攻青州，平卢节度使王师范硬着头皮顶了一下，被朱友宁揍的鼻青脸肿，弟弟王师克也赔了进去。
四月，王师范派人到淮南请杨行密发兵来救。杨行密是朱温的二号冤家，也是逢朱温必反的主儿。派大将王茂章北上救青州。此时汴军已经攻破博昌（今山东博兴），攻至登州（今山东蓬莱）。青州军和淮南军联合作战，非常难得的大破汴军一阵，朱友宁在乱中战马仆地，被青军所杀。
朱温听到噩耗，大怒，亲率虎狼师二十万急赴青州，七月间，汴军开始围攻青州。数破青军，王茂章奈何朱温不得，也不想白白为王师范献身，率军撤回淮南。汴军杨师厚部扑打青州，王师范越打越没脾气，十一月，王师范向朱温投降。朱温留李振权治青州，王师范素衣骑驴，带着家眷数百口迁居汴州，胶东半岛地区全归朱温。
朱温这次东征还有一个收获。就是得到了王师范手下大将刘鄩。刘鄩是五代时最具侠客风骨的名将。刘鄩曾经和朱温手下大将葛从周战于兖州，而葛从周的母亲正在城中。刘鄩公私分明，见到葛母毕恭毕敬，不敢少怠。而且刘鄩把城中的老弱病残全都放出城中。只留下本部兵守城。这等侠骨风范，千载之下仍然让人仰慕不已。孙子所说的为将五条智信仁勇严，刘鄩至少当得起一个“仁”字。后来王师范投降朱温，葛从周劝降，刘鄩这才归顺朱温。朱温也非常喜欢刘鄩，常说他是李勣（就是半仙徐茂公的原型）再世。
刘鄩还有一段**。特别有名，就是刘鄩曾经买下一个卖饼的王家女孩做为侍女，这个王家女孩国色无双，人称“花见羞”。刘鄩死后，王氏带着刘鄩的大把金子投靠了后来成为唐明宗的李嗣源，深得宠幸，并在后唐以及晋汉之际的政治中发挥了一定的影响，这是后话不提。
朱温为了就近控制李晔，强行把李晔“请”到了洛阳，李晔不想去，但架不住朱温的威胁恫吓，只好移驾。行前李晔冲着送行的百姓号哭：“‘纥干山头冻杀雀，何不飞去生处乐。’朕今到处流浪，不知道朕会死在哪里。”左右皆哭。堂堂大唐皇帝沦落成到这个地步，不知道唐太宗李世民地下有知，会做何感想？
李晔行前曾秘拟了一道旨意，分道送给河东的李克用、西川的王建、淮南的杨行密，让他们有朝一日攻灭朱温，恢复唐朝。而这时其他的一些较大藩镇，如吴越的钱镠、福建的王审知、湖南的马殷、广东的刘隐等人则坐山观虎斗，但多是倾向于朱温。
不久，王建、李茂贞、李克用、杨行密等人公开声讨朱温，说朱温欲行篡逆，诸镇将联兵消灭朱温。朱温被骂的七窍冒烟。朱温本想出兵练练这帮大唐的“忠臣”，可又担心李晔在自己的地盘上制造麻烦，决定除掉昭宗，永绝后患。
唐天祐元年（公元904年）八月，朱温派遣朱友恭、氏叔琮以及枢密使蒋玄晖等人去杀李晔。是夜二鼓，蒋玄晖等人率兵扣门请见皇帝，说是急事要面奏官家，内侍不知有诈，开门纳入众人。夫人裴贞一见来者不善，大声质问：“有急事便奏，带兵干什么？”言毕尽，汴将史太一刀将裴夫人砍死。
昭仪李渐荣知道不妙，大呼：“大人勿伤官家！要杀就杀我们！”此时，李晔酒醒，闻变惊起，绕殿而走。史太箭步追上，正欲刺时，李渐荣扑在李晔身上。史太大喝，踢开李渐荣，一剑刺死李晔，时年三十八岁，史太然后杀掉李渐荣。乱兵又捕到何皇后，