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宋骁飞和严复、梁启超、鲁迅、辜鸿铭、容蓉等人谈论文化革新时，还谈到了宗教问题和教会大学的问题。本文由慕烫迷谥泄也很多，李提摩太还是宋骁飞的挚友，所以基督教在中国的发展很快。很多教会学衦驳玫街泄政府的鼓励和批准?
在19世纪晚期，西方基督教会开始在中国创办一些高等教育机构，到了1907年，已蔚为大观，教会大学已经遍布华东、华北、华南、西南各地。有名的教会大学,比如燕京大学、辅仁大学、、圣约翰大学、齐鲁大学、金陵女子大学、金陵大学、东吴大学、沪江大学、福建协和大学、岭南大学、长沙雅礼大学、湖北文华大学、华西协和大学，欧美的大学都承认学历。还有中国神父创设的教会大学，比如上海震旦大学，在国内外都有名气。
辜鸿铭说：“很多人说我们中国人无宗教信仰，我看是不准确的。我们中国人信仰先祖，也信很多鬼神，龙王庙、土地神、儒释道，都应该算。中国民众的宗教信仰，比较复杂。这些是我们中国人心灵的寄托，是中国传统文化的一部分。而基督教和教会大学，则是外来文化，我们要警惕这些外来文化的侵略。”
严复作为教育总长，一直是极力推动教会大学的，听了辜鸿铭的话。反驳说：“辜教授，我们不能说西方文化侵略吧，那样污蔑人家。只会显示我们中国人文化不自信。人类的文化相互交流，好的东西，自然深入人心。不存在侵略一说，很多教会学校，不仅教授数、理、化之类的新式科学课程，也讲授中国传统文化，包括《三字经》、《千字文》、《百家姓》、《四书》、《五经》等。容闳议长。就是美国传教士布朗从马礼逊学堂选送到美国学习的。教会学校，尤其是协和的医科大学，给我们培养了不少医学人才。还比如容闳议长的同学黄宽。成为了经过医科大学正规训练的第一位中国西医。”
梁启超说：“我同意严复总长的观点，教会大学对我国高等教育作出很大贡献，比如东吴大学的法科，协和医学院的医科。这一点应该肯定。而不要说什么文化侵略。好的文化全世界都应该学习。不然，别人会说中国人是非不分。而且，这些教会大学的文凭都得到欧美国家承认，有的学校毕业后，可以直接进入美国大学研究生院学习。大大提高了中国人才的层次。”
宋骁飞说：“我也听李提摩太讲过，教会大学是中西文化交流的重要场所，不少教会大学负责人，都主张教会大学通过吸收中西文化之精华。使之具备明显的文化传播功能。今日之中国，对于外来文化吸收之不暇。遑论拒绝。足见西洋文化之输入，乃为补救中国文化之不足，而决非侵略的。”
辜鸿铭见攻击教会大学不成，便退一步说：“那对于基督教，总不能任其发展吧？我看德国大哲学家尼采的书，就公开说上帝死了。也就是说，上帝根本不存在。现在各地的教堂兴起，儒生们很有意见呢。”
宋骁飞摇摇头，说：“关于这个问题，我曾经和小青聊过，她说关于任何宗教，人们提出的最无聊、最徒劳的问题，就是他们信仰的神，是否存在。而且很多无神论者，都试图证明上帝是不存在的。真正的问题。不在于上帝存不存在，关键是一旦你确定神不存在，你的心灵该如何获得安宁？你和别人之间如何和谐相处？”
辜鸿铭说：“我们，当然可以做一个坚定的无神论者。”
宋骁飞说：“辜教授学富五车，当然没问题。但是对于普通的劳苦大众来说呢？人类发明宗教，我想无非是出于三大原因，一是出于对死亡的恐惧。如果没有信仰，对于自己的死亡，亲人的离去，这种永远灰飞烟灭的恐惧，将伴随你一生。二是人心怀有根深蒂固的**和暴力冲动，这是人的原始兽性，如果没有信仰，社会如何更和谐？三是世俗生活中，难免有各种苦，飞来横祸，生老病死，**得不到满足，宗教则是一种心灵的寄托。所以我一向主张对宗教是宽容的，信仰自由也已经写入了共和国的宪法。”
辜鸿铭说：“大总统说得有道理。我原来以为大总统是武人出身，没什么文化，没想到大总统博学多识。”
宋骁飞说：“我只是看了很多书而已。中国的文化和宗教，我想应该多元化、包容为佳。在印尼殖民地，还有很多伊斯兰的教徒。我们这样一个幅员辽阔的多民族国家，宗教自由和多元文化应该是国策。”
梁启超等人表示赞同，说：“古今中外，宗教冲突引发的战争太多，我国多元文化时期，比如李唐，国力都是比较强盛的。我们应该确定多元文化的国策。”
确定了中国的文化政策之后，在1907年国庆节来临之前，梁启超建议将第二共和国更名为中华帝国，在宪法中明确中国的政治、经济、文化政策，他宣称“帝国是对领土非常辽阔，统治或支配民族众多，拥有极大的国际影响力的强大国家的通称。如罗马帝国、大英帝国等。不一定是实行君主制而拥有殖民地或恣意向外扩张的国家。中国现在横跨欧亚大陆，拥有近1600万平方公里的国土，已经具备了恢复帝国的实力。”
在国会讨论时，有一部分人反对，大多数人赞同梁启超这一建议。宋骁飞也表示赞同，投票在国会以627票高票通过，超过三分之二的议员投赞成票。这一次